>Achillobator giganticus
-------------------------ac-c-----------------------------------------------------aaacac------a-accaa-cccca-------a--acc-cc----------cac-------------aa--cagga--ccccaacac-accaca-aa-gccca-a----aa-aaa-cac----a-------c---a----
>Adasaurus mongoliensis
--------------------------------------------------------------------------------a-a----------------------------------------------------------------------c-ggccc-cc-a-gac-c-c-gc-a----------------------c---a------a----a-----
>Albertosaurus libratus
-caaaa-aa-a-------caaaaacac-c-aaaaaaaccaaaa--gccaa-acaacaaac----aaaaaacaa-caacaaaaaaacacaccacaaaaa--aaacacaaaaaacaaaaaaacaaaa-caaacaaaaaaaacaaaaaaa-acaaacaacaaacaaaaacaccaacaaaaaaaacaaaaaaacaaacaaaaacaaaaaaacaaaaaaaaaaaa-a
>Allosaurus fragilis
-ccaaa-aaaaaaacaaaccaacaaacaa-aaacccaccaaca--aaaaaaaaaacaaacaaaaaaaaaacaaacaaaaaaaaaacacacaacaaaaaaacaacaaaaaaaaaaaaacaaaaaa-ac----aaaaaaaaaaaaaaaa-aaaaacaaaaaacaaaaacaaaaaaaaaaa-aaaaaccaaaaaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaa
>Alvarezsaurus calvoi
--------------------------------------------------------------------------------------------------caa----------g-ca-g-cg------------a-a-aa---------a------aacc--a--g----------------c-aa---a--a--caaaaaaa---a--------c---a----
>Alxasaurus elesitaiensis
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>Anserimimus planinychus
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>Archaeornithomimus asiaticus
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>Archeopteryx lithographica
cac-aaaa--aaa--ccgacaaca--ccc-a-acc-aaacgcaa-ca-aaaa-a--caaccc-c-aaaaacaaaaag-aaaaaga--aacaa-c-c---aa-a--a-a-a---aaccacggccaaa-c--caccccccccaaa-ccaaaaaaaaccgcccaac-catacacg-agc-ac-ccccaaaaa-aaa-accaaaaca-aaaaaaaaaccaaaaa--
>Avimimus portentosus
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>Byronosaurus jaffei
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>Caudipteryx zouiaacca
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>Chirostenotes pergracilis
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>Citipati osmolskae
-accaacaacaac--ggcaaacacccc-aacacc-aaacagcaaaccaaaaaccaaacaaaccacgccga-acaaacaccc-c--------cacccaccaacaccccaac--gac--aagcaaccc-accccaaccacaacaa-ccaaaaaacaaagccaaa--atgaca--cacaccc-gcacaaaaaaaaa-aaaaaaaaaaaaaaaaaaaccagaaaaa
>Compsognathus longipes
-ac-a---------------------c--a-----aaaaa-----cc-------aa---------aaaaaca--c-----aaacacacacaa--ac--aa-----a-a-----aaa---accaaac------a-aaaaaa-ca---a---aa--a---------aacaa-aaa-ac-a---------aa-a---aaaaaaaaaaaccaa-aa----a-----
>Conchoraptor gracilis
-acca----------c---aaccc-c----c-cc-aaa--gcaaacca-aaa-----c-a----cgccga-aca-a-accc-c-----------------aca--c-act-cca--c-----a--c---c-caaccaaaaca--------aacaaagcaaac-ca---ca---acaac--ccaca-a----a--a-aaaa--a-a--aaa-aaccag-a-aa
>Confuciusornis sanctus
cacca--------------c-aaa-aa---aaac---a--g--a--a--aca---ac-------aaaacaaaa-ca-aaac-c--------a----------cac--a-g---a------g--ccc-gcaca--c-ccctaa-cccccaaaaaaccgc-c----c-a-c-cccatg-accg--ca--cc--cgacccacaaca-aaaaaaaaaccagaaa--
>Deinonychus antirrhopus
-acca----c-------c--aaaa-accc-aaacccaaacc------a-c----a-aa-ccacaaaaa-acaaccc-caaa-acacacaaa-ccaaaccaa-ccccacc----aaccacc-cgc------c-ccacccaacaacccaaaaaacaaggcccacccagga-acccc-acaa-ccccaaaaaaaaacaaaccacaacaaa-aaaaaccaaaaa-a
>Dromaeosaurus albertensis
-a--aacaaaaaaaaaaca--a---a-ac---accca----cccc----caaac-caaccaa--aaaaaacaacccccaaa-aaacacaac------------------------------------------------------------------c------------------------------------------c------aa------aa-a-aa
>EK troodontid
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>Erlikosaurus andrews
i-acca--ag-a-c-a--cacaacccaa---aaac-caaaaacaaaacaaa-a--aaaaa--ccccgcaacaaaaaagaaac-aacaaaac-------------------------------------------------a-------------------------------------------------------a-aa-a------aa--ac--aa-a-aa
>Gallimimus bullatus
-acaca-ccaccacacacagcaaacacc--aa-ccaaaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaac-acaaaaaaaaaaacagaaac-c--------aacccaccaaaacaaaaac-caaaaaaaacaacaa------accgaaagaaaaa-a-cacaacaaaaaaccaaaccaacaaaaaacaaaaaaaccaaacaaacaaaaacat-aaaaaccccccacgcccaa
>Gallus gallus*
cacca--------------c-aaa-aa---aaac---a--g--a--a--aca---ac-------aaaacaaaa-ca-aaac-c--------a----------cac--a-g---a------g--ccc-gcaca--c-ccctaa-cccccaaaaaaccgc-c----c-a-c-cccatg-accg--ca--cc--cgacccacaaca-aaaaaaaaaccagaaa--
>Garudimimus brevipes
-aca-----accac-----g-aaacacac-aaa--aaa-aa-aa-a-aaa------aaac--c-a--a--a--a-ag-a-c-c----------------------a---c--a------------------------------------------a-a---a------------a--a--------a--------aaaaaaaa-a--ac--c-c--g-c-a-
>Harpymimus okladnikovi
-a-----------------g-a--------------------------------------------a--aa-aa---------ga--c---------------------a-----------------------------g-aa-aaaaaaca-ca--a-------c-----aa----a-----------------aaaaaa---a-aacacc----c-a---
>Huaxiagnathus orientalis
-ac-a--------------aaac---c--a-a-----aa--a-----------------------aa-aaca--------aaacacaca-aa--a---c--------a------aa---a-caaaca----aaaaaaaaa-aa--aacaaaaaaaaga-a--caaacaa-aaaacc-a--a------a--a-acaaaaaaa-a-acc--aaa----aa-a--
>Incisivosaurus gauthieri
-ac-a---c--ac-----caaa-ccacaaacaac-aca-c-aaaaccaaa-ccacaccacaccccgcacaaaacaac-c-aaagc--aa-a--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------aa--aa--ac-a--a
>Ingenia yanshini
-ac-a----------------c-c------c----------------------------------gccga-acaaa-accc-c--------------------------c---ac----g-aa---aaccccaacc--aaaaa--caaaaaacaaagc------atgacaaccaca-ccaccac-aaaa-aaaca-aaaaaaaaa--aaaa--cc-gaaa-a
>Liaoning ornithomimid
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>Microraptor zhaoianus
a------------------caa--------------------------------------------a--aca-a-c----a-acaaaaa-----aac-c--ac-caaa-ac---acca-cc-gccc-ac-cac-c-cccaca--caacaaaaccacgccc-acccat-c-cccagccaa-ccccc--aa-aaacccaccccca-caa--aaa-cc-aaa---
>Microvenator celer
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>Mononykus olecranus
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>Ornitholestes hermanni
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>Ornithomimus edmonticus
-acaca-cca-cac-cacagcaaacacac-aaaccaaaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaa------aaaaaaaaaca-caac-c------a-aac-caccaaaacaaaaacacaaaaaaaacaacaac-----accgaaagaaaaaaa-cagaacaaaaaaccaaaccaacaaaaaacaaaaaaaccaaacaaacaaaaacat-aa-acccccccacgcccaa
>Oviraptor mongoliensis
-ac-a----a----------accc-c----c-cc-aaaca--aa---aaa-a------aa--c-cgccg--acaaa--ccc-c------------------------------a-----gca---------c--c---aa-a---ca--aaacaaa-c----cc-------------c--------a----a--a-a-------a--aa--aac--g-aa--
>Oviraptor philoceratops
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>Patagonykus puertai
------------------------------------------------------------------------------------------------------ccc--------ca-g----------------aagaa-tacca-cca--cca--------c------c-----ca-aa-cc-c-aa---aaacc-a--a-----ac--a---c---a----
>Pelecanimimus polyodon
-ac-------c--------g-aa----ca-a---------a--a----------------------aa-aaaa-------aaagg--aaac------------------------------------a-aa----g-----aa--aa-caca------------------------------------------------------aaccca----a-----
>Rahonavis ostromi
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>Saurornithoides junior
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>Saurornithoides mongoliensis
-ac--c-c--ccac---a-ccaaac-caa-a--------g-------------------c-aca-caa-aaca--c----aaaccacac---------c---a--a-----caa--c-----------------------------------------------atgaca-aca--ca--cccca-----------a--cca-ac------a--c-a-----
>Saurornitholestes langstoni
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>Segnosaurus galbinensis
------------------------------------------------------------------c--ca-aaaa-aaa---acaaaac-----------------------a--------------------cc---aa--------aca-caagc-aaaa-cagcc-a-caga-a--------aa--a-aa--aaaa-gc-a--aa----c--a-a---
>Shuuvuia deserti
-accacaaaaaaaa-ccgaccaaa-a-a--a-ccc-ccaagcaaaacacacaacaaca---c-caacacacaaaaagcaa-cagg--aaa--accccccacccac-a--c-gacacgacggcacaa-gaaa-aaagaaatacc--ccggaccaaa-c--acc-gaaa-caagcagg-a--gcacaacccaccgccaaaagaaaaa-ccaaaaaccaaaaaac
>Sinornithoides youngi
-a--ac-------------c-aaa--c---a----aa---g-------c-a--------------aa--aaca-------aaacca-ac------cc--aac-----------aacc-caccgcac----c-aa-c-cac-a---caaaaaa----gc--ac--a-ta---cc-a--aa--ccca-----a-----aaa-caaac-a--a-a-c--aa-a--
>Sinornithosaurus milleni
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>Sinosauropteryx prima
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>Sinovenator changii
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>Sinraptor dongi
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>Struthiomimus altus
-acaca-cca--a--cacagcaaacaccc-aa-ccaaaaaaaaaaaaaaaac-a--aaac-ac--aaacaaaaacagaaac-c--------aac-caccaaaacaaaaacacaaaaaaaacaacaac-----accgaaagaaaaaaa-cacaacaaaaaaccaaaccaacaaaaaaaaaaaaaaccaaacaaacaaaaacat-aaaacccccccacgcccaa
>Troodon formosus
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>Tyrannosaurus rex
-caaaa-accaaaacaagcaaaaacacac-aaaaaaaccaaaacagccaaaacaacaaac-aaaaaaaaacaaccaacaaaaaaacacaccacaaaaa-aaaacacaaaaaacaaaa-aacaaa--c-----aaaaaaacaaaa--a--caaacaacaaacaaaaacaccaccaaaaaa-acaacaaaa-aaacaaaaacaaaaaaacaaaaaaaaaaaaaa
>Ukhaa dromaeosaurid
-accaacaacaaaacgaccgaaaacacac-aaac-caaacgcc-ccaaacaaa--aaaac-a--aaaaaacaa-ccccaaacacacacaaa----a--c-------------------------------------------------------------------------------------------------------------a--aa--aa-a-aa
>Unenlagia comahuensis
------------------------------------------------------------------------------------------------------cccc-cc----a------------------c-a--caac------------acggc-ca-ccc-gacac---gccaa-c-ac--a------------------a-------cc-------
>Utahraptor ostrommaysorum
---------------------a---------------aac----------------------------------------a----cac--c-----------c-----------a--acc------------------------------a-a---------------------ca----a----------aa-a---------------------------
>Velociraptor mongoliensis
-accaacaacaaaacgaccgaaaacaccc-aaacccaaacgccc-ca-acaaacaaaacccacaaaaaaacaacccc-aaacacacacaaaacc-aaccaacccccacccccaaaccaccccgcccaacccaccccccaacaacccaaaaaacaaggcccacccaggacaccccgccaacccc-aaaaaaaaacacaccacaacaaaaaaaaaccaaaaaaa